Expedeon的TruePrime?带您探索单细胞基因组的奥秘

单细胞全基因组测序是在单细胞水平上对全基因组进行扩增与测序的一项技术，是近年来研究最为热门最为前沿的技术之一。原理非常简单，首先将要研究的单个细胞分离出来进行全基因组DNA扩增，获得高覆盖率和完整的基因组之后进行高通量测序，进而揭示单个细胞间的基因差异。因此，在扩增过程中获得高覆盖率以及高保真性的扩增产物是得到全面准确测序结果的必要条件。

传统的PCR方法在扩增过程中容易出现较多的扩增偏倚、基因缺失等现象，尤其是在单细胞扩增过程中容易丢失大量序列。而近年来发展出来的MDA（Multiple Displacement Amplification,多重置换扩增）技术不仅具有高分辨率和高基因组覆盖度，而且具有更好的敏感性和特异性，因而是公认较好的单细胞基因组扩增技术。下面就为大家介绍一款来自Expedeon公司基于MDA技术的单细胞全基因组扩增试剂盒TruePrime^? Single Cell WGA Kit。

TruePrime^?采用MDA技术，基于新型的TthPrimPol 引物酶和Phi29 DNA聚合酶，扩增过程无需添加随机引物，减少了扩增偏倚，提高了扩增过程的覆盖率和保真性，并且对于污染的外源DNA不敏感，可重复性好。TruePrime^?可用于单个细胞或少量细胞的全基因组扩增，与常见的NGS平台如Illumina和IonTorrent等兼容性良好。

△图1：基于TthPrimPol 引物酶和Phi29 DNA聚合酶的扩增原理

TruePrime^?技术优势

No1. 起始样本量低

△图2：使用人体全基因组样本进行连续倍比稀释后用TruePrime^?进行扩增，Ion Torrent进行测序分析

结果表明仅使用1fg 的样本即可以扩增出95%以上的人体基因组片段；而使用随机引物扩增的结果中，约有20%不匹配任何生物体的非特异性序列（右下图）。

No2. 高保真性

△图3：分离单个HEK293细胞，按照TruePrime^?说明书扩增3小时和6小时，使用PicoGreen试剂盒检测DNA产量

分析数据表明，TruePrime^?扩增结果和阴性对照组（原始样品）的各项数据差异均最小。

No3. 高覆盖率

△图4：左图：TruePrime^?扩增产物和原始样本的染色体覆盖率对比；

右图：3号染色体图谱的覆盖模型，TruePrime^?扩增得到的DNA与未扩增的DNA覆盖率接近。

扩增能力强，无引物互作，无扩增偏倚，覆盖率高，保真性好，重复性好，集诸多优势于一身的TruePrime^?，还有什么理由不选择呢？TruePrime^?会为您的单细胞测序工作带来极大的便利！除此之外，Expedeon还提供用于扩增cfDNA, circular DNA等多种类型DNA的试剂盒哟！

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Expedeon（英国）是世界领先的生物分子结合技术和服务专业公司。公司为研究机构的科学家和商业生产提供相关试剂产品。公司提供包括基因组学、免疫学、蛋白质组学等相关产品。主要产品线包括Expedeon^?, Lightning-Link^?, InnovaCoat^?,Thunder-Link^?, RunBlue^?, GELFREE^?, TruePrime^?,Sunscript^?, InstantBlue?等。产品提供给全球的科研实验室，制药企业，生物技术和诊断公司等。